Nature子刊：基因測序揭示12種癌症的遺傳易感性

　　12月22日《Nature Communications》雜誌上的一項研究闡述了12種癌症的遺傳(chuan) 性，意外發現胃癌遺傳(chuan) 概率與(yu) 乳腺癌等同，同時還揭示了乳腺癌易感基因BRCA1和BRCA2突變對其他癌症的影響。

　　12種癌症的遺傳(chuan) 性(遺傳(chuan) 性易感性)

　　長期以來，*癌症的部分風險因素為(wei) 遺傳(chuan) ，且遺傳(chuan) 突變在不同腫瘤中的重要性也不一致。華盛頓大學醫學院研究人員析了4000多個(ge) 癌症病例的基因信息，以研究癌症的遺傳(chuan) 性。這些4000多個(ge) 病例均來自美國國立衛生研究院(NIH)組織的癌症基因組圖譜項目。

　　過去的癌症基因組研究主要是比較健康組織與(yu) 癌變組織的測序結果，幫助研究人員確定哪些基因在癌症的發展過程中扮演重要的角色，但這種分析不能區分遺傳(chuan) 突變是天生的還是後天形成的。

　　為(wei) 了梳理癌症的遺傳(chuan) 分量，研究人員在該研究中加入了包含患者胚胎信息的正常細胞相關(guan) 測序數據的分析。患者生殖細胞係來自於(yu) 父母，可揭示先天性的遺傳(chuan) 信息，判斷與(yu) 癌症相關(guan) 的突變是否與(yu) 生俱來。

　　本文資深作者，華盛頓大學McDonnell基因研究所醫學教授Li Ding博士說，“總體(ti) 而言，我們(men) 已經知道卵巢癌和乳腺癌有一個(ge) 重要的遺傳(chuan) 因素，但其他類型的癌症，如急性髓係白血病、肺癌等的遺傳(chuan) 性小一些。”

　　研究人員在所有的分析病例中尋找已知的與(yu) 癌症相關(guan) 的罕見生殖係突變。若出生時其中一個(ge) 親(qin) 本的一個(ge) 基因中的一個(ge) 拷貝發生了突變，來自另一個(ge) 親(qin) 本的正常拷貝通常可將該缺陷掩蓋，但攜帶這種突變的個(ge) 體(ti) 更容易受到“第二次攻擊”，隨著年齡的增長，正常拷貝的基因發生突變的風險值越高。

　　在與(yu) 癌症相關(guan) 的已知的114個(ge) 基因中，研究人員發現了12種癌症的種係突變，但突變頻率取決(jue) 於(yu) 癌症的類型。研究人員專(zhuan) 注於(yu) 一種稱為(wei) “截斷(truncation)”的突變類型，因為(wei) 大部分的截短基因(truncated gene)是不發揮功能的。這12種癌症的遺傳(chuan) 性如下表所示：

　　LUNG1為(wei) 肺鱗狀細胞癌，LUNG2為(wei) 肺腺癌

　　在本次調查中，19%的卵巢癌病例攜帶罕見的生殖係“截斷”突變，相比之下，僅(jin) 有4%的急性髓係白血病患者攜帶這種突變，同時研究人員發現胃癌患者攜帶這種突變的概率為(wei) 11%，與(yu) 乳腺癌患者相當。該研究結果可提高癌症風險基因檢測的準確性。

　　乳腺癌易感基因BRCA1和BRCA2可能影響其他癌症的形成

　　BRCA1和BRCA2基因對DNA修複很重要，且一直以來被認為(wei) 與(yu) 乳腺癌風險相關(guan) ，但該研究揭示了這兩(liang) 個(ge) 基因可能有更廣泛的影響。

　　“我們(men) 發現大量的BRCA1和BRCA2基因生殖係’截斷’突變發生於(yu) 乳腺癌以外的腫瘤，包括胃癌和前列腺癌”，Ding說，“這表明我們(men) 應注意這兩(liang) 個(ge) 基因可能潛在地參與(yu) 了其他類型癌症的發展。BRCA1基因發生生殖係截斷突變的患者，90%的BRCA1截斷突變在腫瘤組織中擴增，且與(yu) 癌症類型無關(guan) 。”

　　對已知乳腺癌風險高的女性進行BRCA1和BRCA2基因檢測可提供重要的預防信息。例如，當基因型正常時乳腺癌遺傳(chuan) 風險值不會(hui) 升高，但如果其中一個(ge) 基因發生了一些可使另外一個(ge) 基因失效的突變，那麽(me) 乳腺癌風險會(hui) 大大增加。

　　突變的類型多種多樣，基因測序還可揭示這些基因突變的許多未知結果，且目前這些突變對癌症風險的影響也是無法預測的。為(wei) 了弄清臨(lin) 床實踐中的灰色地帶，Ding及其同事俄亥俄州立大學計算機生物學和生物信息學家Jeffrey Parvin博士和華盛頓大學醫學教授Feng Chen博士研究了BRAC1基因中意義(yi) 不明確的68個(ge) 種係非截斷突變體(ti) 。對於(yu) 每一種突變，研究人員均測試了BRAC1蛋白如何執行其DNA修複的功能，結果發現其中6個(ge) 突變體(ti) 表現出了*截斷效應——使基因*失效，且這些突變在腫瘤中含量非常豐(feng) 富，在癌症發展中可能扮演著不同的角色。

　　Ding表示，“揭示這六個(ge) 未知突變的臨(lin) 床意義(yi) 非常重要(實際上它們(men) 是導致基因功能喪(sang) 失的突變)。但同時我想強調結果的對比性，許多類型的突變(至少在我們(men) 的研究中)是中性的，我們(men) 想將其識別出來使衛生保健提供者能給患者提出更好的建議。但將此研究結果納入臨(lin) 床之前還需更多的研究來證實。”

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