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3月12日,由華東(dong) 理工大學信息學院、梅斯醫學主辦,主題為(wei) “開放•鏈接•服務”的2016生物醫療大數據研討會(hui) 暨華理-梅斯生物醫藥開放鏈接大數據研究中心成立儀(yi) 式在華東(dong) 理工大學舉(ju) 行,來自複旦大學、交通大學-耶魯大學聯合生物統計中心、中科院係統生物學重點實驗室、曙光醫院、萬(wan) 達信息等高校、科研機構、醫療機構和企業(ye) 的300餘(yu) 位專(zhuan) 家學者與(yu) 會(hui) ,圍繞大數據開放與(yu) 共享、數據關(guan) 聯,大數據關(guan) 鍵技術與(yu) 大數據在生物醫藥行業(ye) 應用等話題展開研討。
同時,研究中心還向參會(hui) 代表贈送了基於(yu) RDF(ResourceDefinitionFramework)格式,關(guan) 聯基因、藥品與(yu) 疾病的約1個(ge) G的開放鏈接數據(LinkedOpenData)集合。互聯網 時代,大數據被認為(wei) 是改變行業(ye) 的關(guan) 鍵節點,生物醫療行業(ye) 亦不例外。
據華東(dong) 理工大學阮彤老師介紹,近年來,生物醫療行業(ye) 的海量數據迅速形成,但相對於(yu) 國外大量開放鏈接數據集對生物醫藥領域研究的促進發展,國內(nei) 的生物醫療行業(ye) 數據封閉、分散且表示方式不一致,製約了整個(ge) 行業(ye) 的發展。為(wei) 此,華東(dong) 理工大學信息學院攜手上海梅斯醫學,在上海市經濟與(yu) 信息化委員會(hui) 指導以及上海市大數據聯盟的大力支持下,成立了“生物醫藥開放鏈接大數據聯合研究中心”,旨在充分發揮雙方優(you) 勢,提供開放的中文基礎生物醫藥數據,關(guan) 聯國內(nei) 外已有的生物醫藥開放鏈接數據,搭建生物醫療大數據研究公共服務平台,為(wei) 生物醫藥大數據挖掘工作提供更多的支撐和服務。
“醫療大數據與(yu) 醫療的聯姻,為(wei) 實現健康醫療的預防、治療、預後等提供了可行之路。”華東(dong) 理工大學劉昌勝副校長表示,近年來,生物醫療行業(ye) 的海量數據迅速形成,同時,伴隨著大數據處理關(guan) 鍵技術的突破、數據開放等契機的發展,大數據將在促進行業(ye) 發展中發揮重要作用。梅斯醫學董事長張發寶認為(wei) ,當前衛生信息化建設的發展很快,與(yu) 醫藥相關(guan) 的行業(ye) 數據正在以的速度增長,大數據應用也已起步,開放醫藥大數據的研究已成為(wei) 熱點,一些大學著手成立大數據研究機構,但是,在數據利用、技術應用等多方麵仍然麵臨(lin) 諸多亟需解決(jue) 的問題。據介紹,生物醫藥大數據挖掘是生物醫藥與(yu) 信息技術的交叉學科。
在大數據挖掘方麵,華東(dong) 理工大學擁有計算機科學、數學以及統計學等學科優(you) 勢,學生團隊曾榮獲2014年百度知識圖譜數據分析競賽一等獎,2015百度大數據競賽一等獎及特別貢獻獎,並且在西班牙舉(ju) 辦的2015年語言學鏈接開放數據競賽中*。目前華東(dong) 理工大學正與(yu) 曙光醫院、萬(wan) 達信息、上海申康合作,共同承擔國家863項目“心血管疾病與(yu) 腫瘤疾病中西醫臨(lin) 床大數據處理分析與(yu) 應用研究”。華東(dong) 理工大學在生物醫藥的相關(guan) 研究領域工作中也取得了一係列成果,在藥物化學領域*期刊——美國《藥物化學》雜誌上發表的研究論文數量也於(yu) 國內(nei) 其他高等院校。按論文發表數量衡量,在*0研究機構中,在“基於(yu) 結構的藥物設計”領域中與(yu) 美國普渡大學並列第三。上海梅斯醫藥科技有限公司作為(wei) 大的醫藥生物和醫療健康產(chan) 業(ye) 服務平台,提供專(zhuan) 業(ye) 醫藥生物信息服務、臨(lin) 床醫學研究協助服務、臨(lin) 床研究成果轉化服務等。特別是在醫學領域具有核心的資源,在臨(lin) 床醫學領域具有強大的學術團隊。
據悉,華理-梅斯生物醫藥大數據研究中心,將從(cong) 開放鏈接大數據和專(zhuan) 注多元化開發模式等方麵為(wei) 進一步推動生物醫藥大數據的發展開展相關(guan) 研究。通過開放鏈接大數據實現“開放•鏈接•服務”。基於(yu) 基礎知識圖譜、提供數據下載、瀏覽、查詢、問答、語義(yi) 標注等技術服務,並在此基礎上,提供電子病曆數據質量檢測、疾病分類、藥品成分查詢等業(ye) 務服務。為(wei) 社會(hui) 公眾(zhong) 提供健康指導,為(wei) 醫療與(yu) 醫藥企業(ye) 提供專(zhuan) 業(ye) 信息服務。在未來三年內(nei) 能為(wei) 政府公共衛生係統提供輔助決(jue) 策谘詢服務,為(wei) 醫院、醫藥企業(ye) 提供疾病知識庫、藥品知識庫等的查詢服務、輔助治療服務。通過共享、反饋,促進知識庫的更新和發展,依托於(yu) 上海大數據產(chan) 業(ye) 創新聯盟與(yu) 中關(guan) 村大數據聯盟,聯合各類醫療機構與(yu) IT機構,形成生物醫藥開放大數據社區,進而逐步實現“開放•鏈接•服務”的服務理念。專(zhuan) 注多元化開發模式加速生物醫藥大數據創新。利用異構數據抽取、整合、處理技術,知識圖譜技術,語義(yi) 標注技術,醫藥大數據挖掘技術的研究及算法並行化改造技術,語義(yi) 質量控製技術等生物醫藥領域的關(guan) 鍵技術展開研究。通過創新基地建設,有效解決(jue) 現有係統封閉、資源分散等問題,大幅提升成果快速轉化擴散能力。
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